A locução "em que pese" tem duas possibilidades de uso:
1. Quando faz referência a coisas, o verbo "pesar" concorda com a coisa referida:
Em que pesem seus bons argumentos, mantenho meu ponto de vista.
Os grandes projetos de Suape, em que pesem todos os efeitos que terão sobre nossa economia, trazem um risco social e ambiental.
2. Quando faz referência a pessoas, o verbo "pesar" rege a preposição "a" e fica invariável:
Em que pese aos radicais, o governo não fará loucuras.
Em que pese ao árbitro incompetente, nosso time venceu fácil.